Kroppens indre ur på celleniveau
Kort svarKroppens indre ur er ikke ét ur. Det er et urværk, der sidder i cellerne, og den molekylære mekanisme bag det blev kortlagt så grundigt, at den udløste Nobelprisen i fysiologi eller medicin i 2017. Kernen er en tilbagekoblingssløjfe: et gen tændes, dets protein hober sig op over timer, og proteinet slukker så sit eget gen igen, hvorefter det nedbrydes og cyklussen begynder forfra. Den runde tager omkring et døgn, og den kører videre i celler, der er taget ud af kroppen. Hos mennesker er omfanget bemærkelsesværdigt: en opgørelse fra 2018 af 13 væv fra 632 donorer fandt, at næsten halvdelen af de proteinkodende gener havde en døgnrytme i mindst ét af vævene. Artiklen forklarer, hvordan urværket fungerer, hvor meget af det der er påvist hos mennesker, og hvad det realistisk betyder.
Hvad artiklen handler om, og hvad den ikke handler om
Der er to niveauer i det, man kalder døgnrytmen, og de er lette at blande sammen.
Det ene er rytmen, som du oplever den: at du bliver søvnig om aftenen, vågner om morgenen, og har mere energi på nogle tidspunkter end andre. Det niveau er behandlet i Hvad er din cirkadiske rytme?, som er kanonisk ejer af det.
Det andet er urværket bag, altså hvad der faktisk tikker inde i en celle. Det er denne artikels emne, og det er et niveau dybere.
Artiklen er beskrivende. Den giver ingen råd om, hvordan du indstiller din rytme, for det hører i Sådan indstiller du din døgnrytme, og lysets rolle står i Hvorfor morgenlys er det vigtigste for din søvn.
Urværket: et gen, der slukker sig selv
Her er mekanismen, og den er værd at forstå, fordi den er overraskende simpel i sin grundform.
Forestil dig et gen, der bliver tændt. Cellen begynder at lave det protein, genet koder for. Proteinet hober sig op i cellen over nogle timer. Og når der er nok af det, gør proteinet noget bemærkelsesværdigt: det slukker sit eget gen.
Så stopper produktionen. Det protein, der er tilbage, bliver gradvist nedbrudt. Og når mængden er faldet nok, bliver genet tændt igen, og runden begynder forfra.
Det er en tilbagekoblingssløjfe, og forskerne kalder den en transkription-translation-tilbagekoblingssløjfe. Nobelkomiteens egen faglige baggrundstekst beskriver den som et nyt paradigme på det tidspunkt, den blev påvist.
Og det afgørende ved den er forsinkelsen. Hvis genet blev slukket i samme øjeblik proteinet blev lavet, ville der ikke være nogen rytme. Det er forsinkelserne, der giver sløjfen sin længde, og baggrundsteksten anfører, at der skal betydelige forsinkelser til for at frembringe svingninger med en periode på omkring 24 timer. De forsinkelser opnås gennem en lang række yderligere reguleringstrin.
Hvem fandt hvad
Rækkefølgen er værd at kende, fordi den viser, hvor langsomt billedet blev samlet.
I 1971 isolerede Seymour Benzer og Ronald Konopka bananfluer med ændrede rytmer: én uden rytme, én med en cyklus på omkring 19 timer og én med omkring 28 timer. Forsøg pegede på, at alle tre handlede om ét gen, som senere fik navnet period.
I midten af 1980'erne klonede og karakteriserede Jeffrey Hall og Michael Rosbash fra Brandeis University og Michael Young fra Rockefeller University det gen. Det er den opdagelse, de tre fik Nobelprisen for i 2017.
Derefter kom resten af urværkets dele: timeless i 1995 fra Youngs laboratorium, og i 1998 generne clock og cycle samt doubletime, det sidste også fra Youngs laboratorium. Baggrundsteksten anfører, at clock først blev identificeret i mus af Joseph Takahashi i 1997.
Hvordan delene arbejder sammen
Det er her, det bliver konkret, og det er også her, det første store forbehold hører.
Alt det følgende er beskrevet i bananflue. Proteinnavnene nedenfor er flueproteiner. Hos mus og mennesker findes tilsvarende dele med andre navne, men den detaljerede koreografi, jeg gengiver her, er fluens.
To proteiner, CLK og CYC, tænder generne period og timeless. Cellen laver så proteinerne PER og TIM. PER og TIM virker derefter som negative regulatorer af CLK, og dermed lukkes sløjfen.
Forsinkelsen skabes blandt andet af to ting. Det ene er nedbrydning: proteinet DBT, kodet af doubletime, sætter en kemisk markering på PER, som øger nedbrydningen af det. Det bidrager til, at der går flere timer fra period-mRNA topper til PER-proteinet topper. Baggrundsteksten angiver netop, at mRNA-toppen ligger tidligt om natten, flere timer før proteintoppen.
Det andet er beskyttelse: TIM binder sig til PER og blokerer nedbrydningen af det, hvilket også påvirker, hvor i cellen PER befinder sig. PER pendler nemlig mellem cellekernen og cytoplasmaet på en tidsstyret måde.
Og så er der lyset. Lys aktiverer et protein kaldet CRY, som binder TIM og fører til, at TIM nedbrydes. Om morgenen betyder tabet af TIM, at PER står ubeskyttet over for DBT og dermed bliver nedbrudt. Det er en af de måder, lys griber direkte ind i urværket.
Hvor i kroppen sidder uret?
Det korte svar er: næsten overalt. Og det er nok den mest overraskende del.
Hos pattedyr findes der et centralt ur i hjernen, i en lille struktur i hypothalamus kaldet den suprachiasmatiske kerne, som forkortes SCN. Nethinden sender lysinformation dertil, og SCN synkroniserer sine egne nerveceller. Derfra regulerer det centrale ur rytmer i resten af kroppen, dels gennem signalstoffer i blodet, dels gennem det autonome nervesystem.
Men SCN er ikke det eneste ur. Nobelkomiteens baggrundstekst anfører, at de fleste perifere organer og væv kan udtrykke døgnsvingninger isoleret, altså uden hjernens medvirken. Og den beskriver dyrets døgnsystem med et billede, der er svært at forbedre: snarere en urmagerbutik end et enkelt ur.
De perifere ure kan synkroniseres af SCN, men baggrundsteksten nævner også andre signaler, der kan stille dem: fødeindtagelse, fysisk aktivitet og temperatur.
Hvor meget af det er påvist hos mennesker?
Her er det nødvendigt at skifte kilde, fordi det meste af den molekylære detalje kommer fra fluer og mus.
En opgørelse offentliggjort i Science Translational Medicine i 2018 undersøgte genudtrykket i 13 menneskelige væv fra 632 donorer. Resultatet er bemærkelsesværdigt: næsten halvdelen af de proteinkodende gener viste sig at have en døgnrytme i mindst ét af de 13 væv.
Omkring 1.000 af de rytmiske gener koder desuden for proteiner, der transporterer eller nedbryder lægemidler, eller som er mål for lægemidler. Forfatterne konkluderer, at biologisk tid kan påvirke, hvordan man reagerer på medicin, og at døgnrytmen bør tages i betragtning, når man vælger behandling.
Men metoden kræver et forbehold, og det er et stort. Forfatterne kendte ikke tidspunktet for, hvornår vævsprøverne var taget. De brugte en algoritme, der rekonstruerer prøvernes rækkefølge i tid ud fra mønstrene i data selv. Det er en anerkendt fremgangsmåde, men den måler ikke tiden, den udleder den. Og den læste kildetekst angiver hverken, hvor mange prøver der indgik, hvordan de rytmiske gener fordelte sig mellem vævene, eller forfatternes egne anførte begrænsninger.
Hvad opgørelsen altså viser, er omfanget: at døgnrytmer i genudtryk er udbredte i menneskeligt væv. Hvad den ikke viser, er, hvordan rytmerne ser ud i en levende, vågen person i løbet af en almindelig dag.
Hvad man kan tage med fra det
Tre ting, som følger af det ovenstående. De er ikke råd om at sove bedre, men om, hvordan man forstår sin egen rytme.
1. Rytmen er ikke en vane, du har lagt dig til
Det, der tikker, er en molekylær sløjfe i dine celler, og den kører videre i celler, der er taget ud af kroppen. Det gør døgnrytmen til noget andet end en tilvant døgnplan.
Det betyder ikke, at rytmen er uforanderlig. Lys griber direkte ind i urværket, og baggrundsteksten kalder lys det afgørende signal til at stille uret. Men mekanismen forklarer, hvorfor rytmen ikke lader sig flytte ved en beslutning alene.
Grundlag: Nobelkomiteens faglige baggrundstekst om prisen i 2017, der beskriver tilbagekoblingssløjfen og anfører, at de fleste perifere organer og væv kan udtrykke døgnsvingninger isoleret. Den molekylære koreografi er beskrevet i bananflue; den tilsvarende mekanisme hos mennesker har andre proteinnavne, og artiklen overfører ikke fluens detaljer til mennesker. At rytmen derfor ikke er en vane, er min formidling af, at sløjfen er molekylær og kører isoleret, og ikke en formulering fra kilden.
2. Der er mere end ét ur, og de kan stilles af forskellige ting
Billedet med urmagerbutikken er værd at holde fast. Når de fleste organer kan svinge på egen hånd, så er spørgsmålet ikke bare, hvad hjernens ur viser, men om urene er enige.
Baggrundsteksten nævner fødeindtagelse, fysisk aktivitet og temperatur som signaler, der kan stille de perifere ure. Det er en forklaring på, hvorfor meget forskellige vaner kan påvirke rytmen, og ikke kun lyset.
Grundlag: Nobelkomiteens baggrundstekst, der anfører, at de fleste perifere organer og væv kan udtrykke døgnsvingninger isoleret, beskriver systemet som snarere en urmagerbutik end et enkelt ur, og nævner fødeindtagelse, fysisk aktivitet og temperatur blandt de signaler, der kan synkronisere perifere ure. Teksten angiver ikke styrken af de signaler, hvor hurtigt de virker, eller hvad der sker, hvis urene ikke er enige, og artiklen hævder intet om det. Artiklen giver ingen råd om måltidstiming; et menneskeforsøg om netop det blev identificeret men kunne ikke læses, og ingen påstand her hviler på det.
3. Hvornår noget sker i kroppen, kan betyde noget
Opgørelsen fra 2018 fandt, at omkring 1.000 af de rytmiske gener angår lægemidler, og forfatterne peger på, at tidspunktet kan have betydning for behandling.
Det er et forskningsperspektiv og ikke noget, du skal handle på. Tidspunktet for din medicin er din læges beslutning, og forfatterne anfører selv, at det er et felt under udvikling. Men det er en nyttig påmindelse om, at kroppen ikke er den samme klokken otte om morgenen og klokken otte om aftenen.
Grundlag: Opgørelsen fra 2018, hvor omkring 1.000 cyklende gener koder for lægemiddeltransportører, nedbrydende enzymer eller lægemiddelmål, og hvor forfatterne konkluderer, at biologisk tid kan påvirke lægemiddelrespons. Opgørelsen er en kortlægning af genudtryk og ikke et forsøg med behandling på forskellige tidspunkter; den dokumenterer ingen klinisk gevinst ved at flytte et doseringstidspunkt. Artiklen giver ingen vejledning om medicin, og formuleringen om, at tidspunktet er lægens beslutning, er projektets guardrail og ikke et udsagn fra kilden.
Hvornår bør du tale med din læge?
Dette er en beskrivende artikel om biologi, og den opstiller ingen kriterier for noget.
Men hvis din rytme er forskudt på en måde, der går ud over dit liv, eller hvis du sover dårligt over længere tid, er det ikke et biologispørgsmål. Tal med din læge ved søvnbesvær, der har varet ved i uger eller forværres, ved søvnighed der påvirker dig i trafikken eller ved maskiner, og ved træthed der ikke står i forhold til, hvordan du sover.
Og ændr ikke tidspunktet for din medicin på baggrund af denne artikel. Det er din læges beslutning.
Jeg stiller ingen diagnoser og anbefaler ingen behandling. En forskudt døgnrytme som selvstændigt emne er planlagt som Sådan nulstiller du en forskudt døgnrytme, og vedvarende søvnbesvær hører i Søvnløshed: forstå hvad der sker, og hvornår du skal søge hjælp.
Hvor kan du starte?
Det, der står fast: urværket er en molekylær tilbagekoblingssløjfe, hvor et protein slukker sit eget gen og derefter nedbrydes, og hvor forsinkelserne giver runden en længde på omkring et døgn. Mekanismen blev kortlagt i bananflue og udløste Nobelprisen i 2017. Hos pattedyr findes et centralt ur i hjernens suprachiasmatiske kerne, men de fleste organer kan svinge på egen hånd, og baggrundsteksten beskriver systemet som en urmagerbutik frem for et enkelt ur. Hos mennesker har næsten halvdelen af de proteinkodende gener en døgnrytme i mindst ét af 13 undersøgte væv.
Det, der ikke står fast: hvordan de mange ure forholder sig til hinanden i en levende, vågen person, og hvad man praktisk kan gøre med den viden ud over det, der allerede er kendt om lys.
Vil du videre, så er Hvad er din cirkadiske rytme? næste skridt, hvis du vil forstå rytmen som du oplever den, og Melatonin: kroppens eget søvnhormon hvis du vil vide, hvordan uret oversættes til et signal om søvn. Hele området samles i Døgnrytme: den komplette guide, og hvad kroppen gør om natten står i Hvad sker der i kroppen, når du sover?
Skrevet af Michael Dahlmann, grundlægger af Livet i Balance Academy. Indholdet er oplysende og erstatter ikke rådgivning fra din læge. Artiklen stiller ingen diagnoser og anbefaler ingen behandling, og den giver ingen vejledning om medicin eller doseringstidspunkter. Artiklens vigtigste forbehold er et artsforbehold: den molekylære koreografi, altså proteinerne PER, TIM, CLK, CYC, DBT og CRY og deres samspil, er beskrevet i bananflue. Hos mus og mennesker findes tilsvarende dele med andre navne, og artiklen overfører ikke fluens detaljer til mennesker som påvist hos mennesker. Det, der i kilden beskrives om pattedyr, er det centrale ur i den suprachiasmatiske kerne, nethindens lysinformation dertil, og at de fleste perifere organer og væv kan udtrykke døgnsvingninger isoleret. Nobelkomiteens faglige baggrundstekst er en formidlende oversigt skrevet til prisen i 2017 og ikke et primærstudie; den angiver ingen oprindelig udgivelsesdato, og dens litteraturgrundlag rækker frem til prisåret. Artiklen gengiver dens beskrivelser og citerer dens egne formuleringer, blandt andet om et nyt paradigme, om betydelige forsinkelser og om en urmagerbutik frem for et enkelt ur. Opgørelsen fra 2018 omfattede 13 menneskelige væv fra 632 donorer. Dens metode kendte ikke prøvernes tidspunkt og rekonstruerede rækkefølgen i tid ud fra mønstrene i data; den måler altså ikke tiden, men udleder den. Antallet af prøver, fordelingen af rytmiske gener mellem vævene og forfatternes egne anførte begrænsninger fremgår ikke af den læste kildetekst, og artiklen angiver derfor ingen af dem. Den fulde forfatterrække kunne heller ikke verificeres ud over førsteforfatteren. Formuleringen om, at næsten halvdelen af de proteinkodende gener cykler, gælder i mindst ét af de 13 væv og ikke i alle væv; det er et mål for udbredelse på tværs af væv og ikke et mål for, hvor stor en del af generne der svinger i en enkelt celle. Opgørelsen er en kortlægning af genudtryk og ikke et forsøg med behandling på forskellige tidspunkter; den dokumenterer ingen klinisk gevinst ved at flytte et doseringstidspunkt, og forfatterne anfører selv, at feltet er under udvikling. Et menneskeforsøg om måltidstiming og perifere rytmer blev identificeret, men kunne ikke læses ad tre forsøgte veje; ingen påstand i artiklen hviler på det, og artiklen giver ingen råd om måltidstiming. Forholdet er uddybet i produktionsnote 4. Der er ikke fundet en dansk myndighedskilde om celleurenes molekylære mekanisme; Sundhedsstyrelsen, sundhed.dk, Patienthåndbogen og Lægehåndbogen behandler ikke emnet på det niveau, og artiklen hviler derfor på internationale kilder. Langvarigt eller forværret søvnbesvær, søvnighed der påvirker trafik eller arbejde ved maskiner, samt træthed der ikke står i forhold til din søvn, bør vurderes af din læge.
Forløbet er undervisning og praktisk vejledning. Det er ikke lægelig behandling og erstatter ikke læge, psykolog eller anden sundhedsfaglig hjælp.
Kilder
- Ibáñez, C. Scientific Background: Discoveries of Molecular Mechanisms Controlling the Circadian Rhythm. Advanced information om Nobelprisen i fysiologi eller medicin 2017. Udgivet af NobelPrize.org, Nobel Prize Outreach. Læst i fuldtekst.
Kildeflag: Dette er en formidlende faglig baggrundstekst udarbejdet til prisuddelingen og ikke et primærstudie eller en systematisk oversigt. Den gengiver og sammenfatter andres forskning, og dens litteraturgrundlag rækker frem til prisåret 2017. Siden angiver ingen oprindelig udgivelsesdato; de årstal, der fremgår ved læsningen, er citerings- og adgangsdatoer. Afgørende artsforbehold: den detaljerede molekylære koreografi med PER, TIM, CLK, CYC, DBT og CRY er beskrevet i bananflue. Teksten anfører, at genet clock først blev identificeret i mus af Joseph Takahashi i 1997, men artiklen overfører ikke fluens samspil til mennesker som påvist hos mennesker. Det, teksten anfører om pattedyr, er: at den suprachiasmatiske kerne i hypothalamus er det centrale ur, at nethinden sender lysinformation dertil, at det centrale ur regulerer kroppens rytmer via signalstoffer i blodet og det autonome nervesystem, at de fleste perifere organer og væv kan udtrykke døgnsvingninger isoleret, og at perifere ure kan synkroniseres af den suprachiasmatiske kerne samt af fødeindtagelse, fysisk aktivitet og temperatur. Formuleringerne om et nyt paradigme, om betydelige forsinkelser og om snarere en urmagerbutik end et enkelt ur er tekstens egne og er gengivet som sådan. Teksten angiver ingen styrke for de synkroniserende signaler, ingen tidshorisont for deres virkning, og intet om konsekvenserne, hvis urene ikke er enige; artiklen hævder intet om det. Teksten krediterer ingen opdager af cryptochrome, og artiklen angiver derfor ingen. Nobelprisen er en anerkendelse og ikke i sig selv evidens; artiklen bruger baggrundsteksten for dens faglige indhold og ikke prisen som argument.
- Ruben, M. D. m.fl. A database of tissue-specific rhythmically expressed human genes has potential applications in circadian medicine. Science Translational Medicine, 2018, 10(458), artikel eaat8806. DOI: 10.1126/scitranslmed.aat8806. Læst som resumé via tidsskriftets egen resumé-side.
Kildeflag: Fuldteksten kunne ikke skaffes: tidsskriftets artikelside blev afvist, og den biomedicinske artikeldatabase PMC svarede med en robotkontrol. Oplysningerne stammer fra tidsskriftets resumé-side, og forfatternes egne anførte begrænsninger er derfor ikke gennemgået; artiklens forbehold om opgørelsen er mine, udledt af den beskrevne metode. Den fulde forfatterrække kunne ikke verificeres ud over førsteforfatteren, og artiklen angiver derfor ikke mere, end der kunne bekræftes. Verificeret indhold: 13 menneskelige væv fra 632 donorer; metoden CYCLOPS, som rekonstruerer prøvernes rækkefølge i tid når tidspunktet ikke er kendt; at næsten halvdelen af de proteinkodende gener cyklede i mindst ét af de 13 væv; at omkring 1.000 af de cyklende gener koder for lægemiddeltransportører, nedbrydende enzymer eller lægemiddelmål; og forfatternes konklusion om, at biologisk tid kan påvirke lægemiddelrespons. Ikke verificeret og derfor ikke gengivet: antallet af prøver, fordelingen af rytmiske gener mellem vævene, hvor mange gener der cyklede i flere væv, og heterogenitet eller usikkerhedsmål. Metodisk hovedforbehold: tidspunktet for prøverne var ukendt og blev udledt af data. Det er en anerkendt fremgangsmåde, men den måler ikke tiden. Dertil er et vævsatlas et øjebliksbillede af genudtryk og ikke en måling af rytmer i en levende, vågen person. Tallet om næsten halvdelen gælder i mindst ét af 13 væv og er et mål for udbredelse på tværs af væv, ikke for hvor stor en del af generne der svinger i en enkelt celle; artiklen oplyser det tre steder. Opgørelsen er en kortlægning og ikke et behandlingsforsøg; den dokumenterer ingen klinisk gevinst ved at ændre doseringstidspunkter, og artiklen giver ingen medicinvejledning.
Ofte stillede spørgsmål
Nobelkomiteens baggrundstekst anfører, at de fleste perifere organer og væv kan udtrykke døgnsvingninger isoleret, altså uden hjernens medvirken, og den beskriver systemet som snarere en urmagerbutik end et enkelt ur. Hos mennesker fandt en opgørelse fra 2018, at næsten halvdelen af de proteinkodende gener havde en døgnrytme i mindst ét af 13 undersøgte væv. Rytmer i genudtryk er altså udbredte i kroppens væv.
Fordi der er indbygget forsinkelser. Et protein slukker sit eget gen, men først når der er hobet nok op af det, og derefter skal det nedbrydes, før genet tændes igen. Baggrundsteksten anfører, at der skal betydelige forsinkelser til for at frembringe svingninger med en periode på omkring 24 timer, og at de opnås gennem en lang række reguleringstrin. I bananflue bidrager blandt andet en kemisk markering, der fremskynder nedbrydningen af proteinet, til forsinkelsen.
Delvist, og det er vigtigt at skelne. Selve princippet med en tilbagekoblingssløjfe gælder bredt, og et af urværkets gener blev først identificeret i mus. Men de konkrete proteinnavne og deres detaljerede samspil, som artiklen gengiver, er fluens. Hos mennesker har de tilsvarende dele andre navne, og artiklen hævder ikke, at fluens koreografi er påvist hos mennesker.
Lys griber direkte ind i urværket, og baggrundsteksten kalder det det afgørende signal til at stille uret. Den nævner desuden fødeindtagelse, fysisk aktivitet og temperatur som signaler, der kan synkronisere de perifere ure. Men teksten angiver ikke, hvor stærke de signaler er, eller hvor hurtigt de virker, og artiklen giver ingen råd om måltidstiming. Hvordan man praktisk arbejder med sin rytme, hører i artiklen om at indstille døgnrytmen.
Opgørelsen fra 2018 fandt, at omkring 1.000 af de rytmiske gener koder for lægemiddeltransportører, nedbrydende enzymer eller lægemiddelmål, og forfatterne peger på, at biologisk tid kan påvirke lægemiddelrespons. Men det er en kortlægning af genudtryk og ikke et forsøg med behandling på forskellige tidspunkter. Ændr ikke tidspunktet for din medicin på det grundlag; det er din læges beslutning.
Det skal læses med to forbehold. Det gælder i mindst ét af de 13 undersøgte væv og ikke i alle væv, så det er et mål for udbredelse på tværs af kroppen. Og forfatterne kendte ikke tidspunktet for prøverne; de brugte en algoritme, der rekonstruerer rækkefølgen i tid ud fra data selv. Metoden er anerkendt, men den måler ikke tiden, den udleder den.
Læs videre
Vil du se hormonerne i sammenhæng?
Hele emnet samles i Hormoner og søvn: den komplette guide.
